L’àcid 3-indoleacètic és una mena d’auxina vegetal. L’auxina té molts efectes fisiològics relacionats amb la seva concentració. Una concentració baixa pot afavorir el creixement i una alta concentració inhibirà el creixement fins i tot matant plantes. Aquest efecte inhibitori està relacionat amb si pot induir la formació d’etilè. Els efectes fisiològics de l’auxina es manifesten en dos nivells. A nivell cel·lular, l’auxina pot estimular la divisió de les cèl·lules de cambium; estimular l’allargament de les branques i inhibir el creixement de les cèl·lules de l’arrel; afavoreixen la diferenciació de les cèl·lules del xilema i del floema, afavoreixen l’arrel d’esqueixos i regulen la morfologia del call. A nivell d’òrgans i plantes senceres, l’auxina funciona des de les plàntules fins a la maduració dels fruits. L’auxina controla la inhibició reversible de la llum vermella de l’allargament dels hipocotils a les plàntules; quan es transfereix a la part inferior dels brots, produeix geotropisme de branca; quan es transfereix a la part de contrallum dels brots, produeix fototropisme de branca; L’àcid 3-indoleacètic provoca avantatges apicals i retarda la senescència de les fulles. L’auxina afavoreix la floració, indueix el desenvolupament de fruits partenocarpis i retarda la maduresa del fruit.